Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LACTB2Q53H82 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms