Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HSD17B12Q53GQ0 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms