Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SLC39A12Q504Y0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC39A12Q504Y0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms