Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DUSP28Q4G0W2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms