Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC57Q2TAC2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC57Q2TAC2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms