Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TYSND1Q2T9J0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms