Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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CDO1Q16878 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDO1Q16878 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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