Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP2B3Q16720 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP2B3Q16720 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
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