Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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