Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LY6EQ16553 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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LY6EQ16553 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LY6EQ16553 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LY6EQ16553 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LY6EQ16553 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LY6EQ16553 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LY6EQ16553 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LY6EQ16553 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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