Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYCP1Q15431 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms