Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PUM3Q15397 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PUM3Q15397 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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