Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDCD1Q15116 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms