Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCOLCEQ15113 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCOLCEQ15113 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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