Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RFTN1Q14699 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms