Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP1BQ14684 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RRP1BQ14684 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
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