Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC1AQ14683 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMC1AQ14683 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms