Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PDE7AQ13946 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
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PDE7AQ13946 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PDE7AQ13946 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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PDE7AQ13946 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PDE7AQ13946 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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