Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2H2Q13888 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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GTF2H2Q13888 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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GTF2H2Q13888 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GTF2H2Q13888 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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