Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PEX6Q13608 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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