Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IRF5Q13568 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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