Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NAE1Q13564 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NAE1Q13564 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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