Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCIRG1Q13488 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCIRG1Q13488 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
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