Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TOP3AQ13472 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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