Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SLC10A2Q12908 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLC10A2Q12908 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms