Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 YHL041WYHL041W 450 nt-1.08□□□□□ -2.58
TY1B-NL1Q12112 IRC13YOR235W 315 nt-1.09□□□□□ -2.58
TY1B-NL1Q12112 TAR1YLR154W-C 375 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt-1.1□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YGL015CYGL015C 393 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 snR34snR34 203 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YML007C-AYML007C-A 111 nt-1.11□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 CMC1YKL137W 336 nt-1.12□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 snR5snR5 204 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YER079WYER079W 633 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt-1.13□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 EST1YLR233C 2100 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YDR220CYDR220C 294 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 HUR1YGL168W 333 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 POP7YBR167C 423 nt-1.14□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 MATALPHA2YCR039C 633 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 HMRA2YCR096C 360 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 snR72snR72 98 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YGL123C-AYGL123C-A 231 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YPT6YLR262C 648 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 ATG16YMR159C 453 nt-1.15□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 YCR100CYCR100C 951 nt-1.16□□□□□ -2.59
TY1B-NL1Q12112 AGA2YGL032C 264 nt-1.16□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 MRPL32YCR003W 552 nt-1.17□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 PAU9YBL108C-A 129 nt-1.17□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YOR015WYOR015W 360 nt-1.17□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YPL182CYPL182C 384 nt-1.17□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 SDH7YDR511W 402 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YLR041WYLR041W 321 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YLR282CYLR282C 342 nt-1.18□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt-1.19□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YML100W-AYML100W-A 174 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YPR039WYPR039W 336 nt-1.21□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 SNU13YEL026W 381 nt-1.22□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 APQ13YJL075C 417 nt-1.22□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 SGF11YPL047W 300 nt-1.22□□□□□ -2.6
TY1B-NL1Q12112 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YLR334CYLR334C 381 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YNL058CYNL058C 951 nt-1.23□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YMR254CYMR254C 309 nt-1.24□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YGL230CYGL230C 444 nt-1.25□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.25□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YDL011CYDL011C 324 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 BLI1YKL061W 342 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YPR092WYPR092W 306 nt-1.26□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YIL032CYIL032C 357 nt-1.27□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 AIM29YKR074W 468 nt-1.27□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YCR001WYCR001W 315 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 YDR366CYDR366C 399 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 APQ12YIL040W 417 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 TSC3YBR058C-A 243 nt-1.28□□□□□ -2.61
TY1B-NL1Q12112 RPL22BYFL034C-A 369 nt-1.29□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YER135CYER135C 393 nt-1.3□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 FYV7YLR068W 456 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YGL182CYGL182C 324 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt-1.31□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YER175W-AYER175W-A 165 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YLR217WYLR217W 324 nt-1.32□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YFL063WYFL063W 456 nt-1.33□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YGR025WYGR025W 303 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YHR130CYHR130C 336 nt-1.34□□□□□ -2.62
TY1B-NL1Q12112 YAR029WYAR029W 225 nt-1.35□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YNL303WYNL303W 348 nt-1.35□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 ZEO1YOL109W 342 nt-1.35□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-1.35□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 MND1YGL183C 660 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 CUP1-1YHR053C 186 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 CUP1-2YHR055C 186 nt-1.37□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt-1.38□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-1.38□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YER084W-AYER084W-A 513 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YPL068CYPL068C 882 nt-1.39□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YDR426CYDR426C 378 nt-1.41□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 YJL182CYJL182C 318 nt-1.41□□□□□ -2.63
TY1B-NL1Q12112 SDH6YDR379C-A 240 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 YBL062WYBL062W 381 nt-1.42□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 snR9snR9 187 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 tP(UGG)QtP(UGG)Q 72 nt-1.44□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 YBL071CYBL071C 309 nt-1.45□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 YKL083WYKL083W 615 nt-1.46□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 snR49snR49 165 nt-1.47□□□□□ -2.64
TY1B-NL1Q12112 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.47□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-1.48□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 YPL229WYPL229W 621 nt-1.48□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 tY(GUA)QtY(GUA)Q 84 nt-1.49□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.49□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-1.5□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 SCEIQ0160 708 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 YKL044WYKL044W 321 nt-1.52□□□□□ -2.65
TY1B-NL1Q12112 snR189snR189 189 nt-1.54□□□□□ -2.66
TY1B-NL1Q12112 YOR161W-AYOR161W-A 81 nt-1.55□□□□□ -2.66
TY1B-NL1Q12112 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-1.57□□□□□ -2.66
TY1B-NL1Q12112 YJR087WYJR087W 351 nt-1.57□□□□□ -2.66
TY1B-NL1Q12112 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-1.59□□□□□ -2.66
TY1B-NL1Q12112 YFL012WYFL012W 447 nt-1.6□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.8 ms