Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CPSF1Q10570 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CPSF1Q10570 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CPSF1Q10570 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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