Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SSRP1Q08945 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms