Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PDE4CQ08493 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDE4CQ08493 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms