Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM3Q08188 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms