Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SRSF4Q08170 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms