Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LTBQ06643 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LTBQ06643 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms