Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GCNT1Q02742 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GCNT1Q02742 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms