Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms