Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MDM2Q00987 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MDM2Q00987 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms