Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK16Q00536 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK16Q00536 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms