Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms