Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNA1P78396 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNA1P78396 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms