Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ASIC1P78348 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ASIC1P78348 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms