Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SNRPNP63162 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNRPNP63162 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms