Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GNB1P62873 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GNB1P62873 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GNB1P62873 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GNB1P62873 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms