Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RAB25P57735 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RAB25P57735 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAB25P57735 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAB25P57735 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms