Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GFRA1P56159 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GFRA1P56159 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms