Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SH3BGRP55822 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SH3BGRP55822 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms