Protein–RNA interactions for Protein: P53552

THO2, THO complex subunit 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THO2P53552 YGR228WYGR228W 345 nt-1.84□□□□□ -2.7
THO2P53552 YPL261CYPL261C 309 nt-1.84□□□□□ -2.7
THO2P53552 YDR269CYDR269C 324 nt-1.85□□□□□ -2.71
THO2P53552 snR189snR189 189 nt-1.85□□□□□ -2.71
THO2P53552 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt-1.86□□□□□ -2.71
THO2P53552 BER1YLR412W 825 nt-1.86□□□□□ -2.71
THO2P53552 SPC24YMR117C 642 nt-1.88□□□□□ -2.71
THO2P53552 RSM18YER050C 417 nt-1.89□□□□□ -2.71
THO2P53552 RUF20RUF20 443 nt-1.89□□□□□ -2.71
THO2P53552 YJL086CYJL086C 369 nt-1.89□□□□□ -2.71
THO2P53552 YOR366WYOR366W 354 nt-1.89□□□□□ -2.71
THO2P53552 snR5snR5 204 nt-1.9□□□□□ -2.71
THO2P53552 PMP2YEL017C-A 132 nt-1.9□□□□□ -2.71
THO2P53552 YPL068CYPL068C 882 nt-1.9□□□□□ -2.71
THO2P53552 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt-1.91□□□□□ -2.72
THO2P53552 YPR092WYPR092W 306 nt-1.91□□□□□ -2.72
THO2P53552 YDR290WYDR290W 330 nt-1.92□□□□□ -2.72
THO2P53552 CUP1-1YHR053C 186 nt-1.94□□□□□ -2.72
THO2P53552 CUP1-2YHR055C 186 nt-1.94□□□□□ -2.72
THO2P53552 YOR170WYOR170W 306 nt-1.95□□□□□ -2.72
THO2P53552 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-1.96□□□□□ -2.72
THO2P53552 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-1.96□□□□□ -2.72
THO2P53552 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt-1.96□□□□□ -2.72
THO2P53552 SCEIQ0160 708 nt-1.97□□□□□ -2.72
THO2P53552 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt-1.98□□□□□ -2.73
THO2P53552 YER135CYER135C 393 nt-1.99□□□□□ -2.73
THO2P53552 COX7YMR256C 183 nt-1.99□□□□□ -2.73
THO2P53552 snR24snR24 89 nt-1.99□□□□□ -2.73
THO2P53552 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt-2.01□□□□□ -2.73
THO2P53552 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt-2.01□□□□□ -2.73
THO2P53552 RPL22BYFL034C-A 369 nt-2.02□□□□□ -2.73
THO2P53552 PET20YPL159C 762 nt-2.02□□□□□ -2.73
THO2P53552 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt-2.02□□□□□ -2.73
THO2P53552 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt-2.03□□□□□ -2.73
THO2P53552 HUR1YGL168W 333 nt-2.04□□□□□ -2.74
THO2P53552 VPS20YMR077C 666 nt-2.04□□□□□ -2.74
THO2P53552 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt-2.04□□□□□ -2.74
THO2P53552 snR74snR74 88 nt-2.05□□□□□ -2.74
THO2P53552 SRB7YDR308C 423 nt-2.06□□□□□ -2.74
THO2P53552 YGL015CYGL015C 393 nt-2.06□□□□□ -2.74
THO2P53552 THG1YGR024C 714 nt-2.06□□□□□ -2.74
THO2P53552 SGF11YPL047W 300 nt-2.06□□□□□ -2.74
THO2P53552 IRC16YPR038W 360 nt-2.06□□□□□ -2.74
THO2P53552 CBS1YDL069C 690 nt-2.07□□□□□ -2.74
THO2P53552 YDR366CYDR366C 399 nt-2.07□□□□□ -2.74
THO2P53552 snR72snR72 98 nt-2.08□□□□□ -2.74
THO2P53552 DFG10YIL049W 762 nt-2.08□□□□□ -2.74
THO2P53552 RDS3YPR094W 324 nt-2.09□□□□□ -2.74
THO2P53552 YGL052WYGL052W 306 nt-2.1□□□□□ -2.75
THO2P53552 YKL202WYKL202W 582 nt-2.1□□□□□ -2.75
THO2P53552 CWC23YGL128C 852 nt-2.1□□□□□ -2.75
THO2P53552 BNS1YGR230W 414 nt-2.12□□□□□ -2.75
THO2P53552 MND1YGL183C 660 nt-2.13□□□□□ -2.75
THO2P53552 CDC65tQ(CUG)M 72 nt-2.14□□□□□ -2.75
THO2P53552 VPS63YLR261C 327 nt-2.14□□□□□ -2.75
THO2P53552 snR81snR81 201 nt-2.15□□□□□ -2.75
THO2P53552 YKL063CYKL063C 504 nt-2.15□□□□□ -2.75
THO2P53552 AIM29YKR074W 468 nt-2.16□□□□□ -2.76
THO2P53552 YOL106WYOL106W 354 nt-2.16□□□□□ -2.76
THO2P53552 SDH6YDR379C-A 240 nt-2.18□□□□□ -2.76
THO2P53552 YER053C-AYER053C-A 114 nt-2.18□□□□□ -2.76
THO2P53552 POP7YBR167C 423 nt-2.18□□□□□ -2.76
THO2P53552 snR51snR51 107 nt-2.18□□□□□ -2.76
THO2P53552 ACF4YJR083C 930 nt-2.19□□□□□ -2.76
THO2P53552 YNL058CYNL058C 951 nt-2.19□□□□□ -2.76
THO2P53552 LSM4YER112W 564 nt-2.19□□□□□ -2.76
THO2P53552 YER188C-AYER188C-A 300 nt-2.2□□□□□ -2.76
THO2P53552 snR59snR59 78 nt-2.22□□□□□ -2.76
THO2P53552 EAF6YJR082C 342 nt-2.22□□□□□ -2.76
THO2P53552 YPL229WYPL229W 621 nt-2.22□□□□□ -2.76
THO2P53552 YGL239CYGL239C 315 nt-2.23□□□□□ -2.77
THO2P53552 YHR125WYHR125W 306 nt-2.23□□□□□ -2.77
THO2P53552 YPT6YLR262C 648 nt-2.23□□□□□ -2.77
THO2P53552 JLP2YMR132C 627 nt-2.23□□□□□ -2.77
THO2P53552 ZEO1YOL109W 342 nt-2.23□□□□□ -2.77
THO2P53552 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt-2.25□□□□□ -2.77
THO2P53552 HMLALPHA2YCL067C 633 nt-2.26□□□□□ -2.77
THO2P53552 MATALPHA2YCR039C 633 nt-2.26□□□□□ -2.77
THO2P53552 HMRA2YCR096C 360 nt-2.26□□□□□ -2.77
THO2P53552 YGR025WYGR025W 303 nt-2.27□□□□□ -2.77
THO2P53552 FYV7YLR068W 456 nt-2.27□□□□□ -2.77
THO2P53552 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt-2.27□□□□□ -2.77
THO2P53552 snR77snR77 88 nt-2.28□□□□□ -2.77
THO2P53552 YOR121CYOR121C 306 nt-2.3□□□□□ -2.78
THO2P53552 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.3□□□□□ -2.78
THO2P53552 YBR285WYBR285W 435 nt-2.31□□□□□ -2.78
THO2P53552 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2.32□□□□□ -2.78
THO2P53552 YKL100W-AYKL100W-A 90 nt-2.32□□□□□ -2.78
THO2P53552 CSE2YNR010W 450 nt-2.34□□□□□ -2.78
THO2P53552 YAR029WYAR029W 225 nt-2.35□□□□□ -2.79
THO2P53552 YOR364WYOR364W 369 nt-2.35□□□□□ -2.79
THO2P53552 YJR087WYJR087W 351 nt-2.36□□□□□ -2.79
THO2P53552 ILM1YJR118C 612 nt-2.37□□□□□ -2.79
THO2P53552 snR39BsnR39B 96 nt-2.37□□□□□ -2.79
THO2P53552 YNL205CYNL205C 423 nt-2.38□□□□□ -2.79
THO2P53552 YLR334CYLR334C 381 nt-2.39□□□□□ -2.79
THO2P53552 YDR354C-AYDR354C-A 144 nt-2.4□□□□□ -2.79
THO2P53552 YGL230CYGL230C 444 nt-2.4□□□□□ -2.79
THO2P53552 YKL044WYKL044W 321 nt-2.4□□□□□ -2.79
THO2P53552 YLR456WYLR456W 615 nt-2.41□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms