Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLCN3P51790 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms