Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIP4K2AP48426 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIP4K2AP48426 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms