Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RPL35P42766 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RPL35P42766 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RPL35P42766 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms