Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ACVR1BP36896 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms