Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RFC4P35249 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RFC4P35249 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RFC4P35249 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RFC4P35249 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RFC4P35249 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC4P35249 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC4P35249 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RFC4P35249 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms